一、一台主机使用两个硬盘的前提条件
机箱是否还有足够的空间可用来安置第二块硬盘、主板上是否还有第二个IDE接口、机箱的电源功率是否能充分满足加了第二块硬盘后整台电脑系统的正常运行等。
二、使用两个硬盘前的设置
在安装第二块硬盘时需要注意的一个问题就是跳线问题，即正确设置主从盘。
设置主从盘的目的是为了告诉系统那块是启动盘，设置为主盘的是安装有操作系统的启动盘。不过如果您是将第二块硬盘直接连接到主板的IDE2端口，而不是跟第一块硬盘接在同一个IDE端口时，就不需要进行主从设置了，系统会自动从挂在IDE1上的硬盘启动，而挂在IDE2上的硬盘即自动被置为从盘。
至于设置主从盘的方法也比较简单，一般来说在硬盘的背面上都有将硬盘设置为主、从盘的方法，默认的设置是将硬盘作为主盘（即Master盘），而作为从盘的那块硬盘需要设置为Slave（即从盘），可以参照硬盘背面的跳线图进行跳线。对于不同的硬盘其设置主从方法是不一样得，所以这里也不可能介绍一个普遍适用的方法。
下面就介绍两种设置主、从盘的方法
①由硬盘跳线器设置
所有的IDE设备包括硬盘都使用一组跳线来确定安装后的主、从状态。硬盘跳线器大多设置在电源联接座和数据线联接插座之间的地方(也有设在电路板上的)，通常由3组(6或7)针或4组(8或9)针再加一个或两个跳线帽组成。另外在硬盘正面或反面一定还印有主盘(Master)、从盘(Slave)以及由电缆选择(Cableselect)的跳线方法。
各类硬盘的跳线方法和标记说明大同小异，比如昆腾硬盘的跳线器通常有9针4组，其中一根叫"Key"，用于定位以便用户正确识别跳线位置。
②由硬盘跳线器和40芯特制硬盘线配合确定
这种主、从盘的设置是先将硬盘跳线设置在"电缆选择有效"后，然后再根据需要将主、从盘联接在对应的硬盘线插头上。硬盘主、盘状态的设置取决于硬盘与硬盘线的联接插头。通常联接硬盘线中段插头的盘是主盘，联接在硬盘线尽头插头上的盘就是从盘。采用这种方法设置主、从盘时，必须将联接在同一条硬盘线的所有IDE接口设备(包括光驱等)跳线器设置在"电缆选择"位置。
能决定硬盘主、从盘状态40芯硬盘线是特制的。制作方法是将普通40芯硬盘线的第28根线(从第1根红线或其它标记开始数)在两个硬盘插头之间的位置上切断后做成的，切线时注意不能弄断其它线。使用特制硬盘线确定主、从盘状态的优点是使用方便。当需要交换硬盘主、从状态时只要将联接的硬盘线插头位置对调一下即可，不需要拆下硬盘来重新跳线。
在选择到底哪块硬盘作为主盘，哪块硬盘作为从盘时，下面给出一个原则：性能好的硬盘作为主盘，而性能稍微次些的硬盘作为从盘。例如你有一款5400RPM的硬盘，一款7200RPM的硬盘，那当然是选7200RPM的硬盘作为主盘了。如果不想破坏旧硬盘上的数据，而又想将老硬盘作为从盘，那最好的方法就是备份数据，然后再重装，如果没有备份媒介，那你可以使用GHOST软件将两块硬盘对COPY一下，然后将旧老的硬盘分区格式化后作为从盘就可以了！不过使用GHOST软件应注意，最好两款硬盘是等容量得，如果不等，至少要求目标盘的容量比源盘大。
三、问题
正确安装完了双硬盘后，须进入CMOS中正确设置两块硬盘的参数。
当所有这些工作都完成时，你的双硬盘存储系统差不多就完成了。为了方便后来的叙述，我们将双硬盘用户分成两类，第一类用户是装完了双硬盘后，从零开始重装系统，对于此类用户就不要有后面发生问题了，用户只须运行FDISK分区硬盘，将格式化装系统就OK了；除了上面得那类用户，还有些用户为了保存原有硬盘上的数据，不是从零开始重装系统，而是在老硬盘上的基础上升级成双硬盘系统，或者只是将第二块硬盘作为数据备份等用，对于这类用户，在装完了双硬盘后最常发生的问题就是"盘符错乱"，即在安装了第二块硬盘后，第一块硬盘中D盘符发生错乱，使得原来是D盘下的软件没法使用。如你原来的第一块硬盘分二个区C、D两个区在IDE1，而新买的第二硬盘分为C、D、E三个区在IDE2。
四、双硬盘在我的电脑中对应的盘符
在安装了双硬盘并且在CMOS中正确设置了两块硬盘参数后，查看"我的电脑"，会发现原来在老硬盘D区的所有内容现在全都跑到E区去了，而D区变成了第二块硬盘的第一个区，各个分区的具体分布如下：
C区（老硬盘）、D区（新硬盘）、E区（老硬盘）、F区（新硬盘）、G区（新硬盘）…依此类推。