一、Autoexec.bat文件
autoexec.bat文件是操作系统开机启动时的自启动文件，它来自DOS操作系统，可以将每次开机时需要运行的软件程序的执行命令写在文件里，就可在机器启动时自动运行了。
目前，很多Windows下安装的程序需开机启动的都直接写进了注册表，所以，C盘根目录下的autoexec.bat文件中往往是空的。也就是说，就目前而言，基本都不使用autoexec.bat文件了，我们可以将其删除而不影响系统。
二、Winstart.bat文件
Winstart.bat是一个特殊性丝毫不亚于Autoexec.bat的批处理文件，说它特殊，原因有六：
1.是名称特殊，如果改为其它名称，则如同自动批处理被改名一样不能起到自动执行的效果;
2.是位置特殊，它必须位于Windows的安装目录，如C:\windows等；
3.是作用特殊，它多数情况下为应用程序及Win98自动生成，因为安装某些新的应用软件后（如某些声卡的驱动程序等），由于程序共享冲突的原因一些系统设置不能被立即更改，再次启动系统时就可通过在Windows目录下生成一个该名称的批处理，以可靠地自动完成余下的任务；
4.是执行顺序特殊，它是在执行了Win.com，并加载了多数驱动程序之后开始执行（这一点可通过启动时按F8键再选择逐步跟踪启动过程的启动方式可得知）;
5.是存在形式特殊，一般情况下很难看到它的神秘身影，即使难得有应用程序在安装时创建了它，一旦完成任务之后系统又很快将其删除；但如果你自己创建了一个，则系统又不会自动删除它；
6.是禁止其执行的方式特殊，用一步一步跟踪启动过程以回答“Y”或“N”的方法对其它驱动程序的加载与否都很奏效，但Winstart.bat却对你的分步执行毫不理会，除非用安全模式启动。Win 98可以完全不需要Config.sys和Autoexec.bat也能很好运行，实际上，Win 98的DOS引导文件Io.sys和Msdos.sys已包含了Config.sys的功能（如自动加载Himem.sys等），而Autoexec.bat的功能却可以由Winstart.bat帮助完成，我们可以在Windows安装目录下建立一个Winstart.bat批处理，然后将自动批处理中的一些语句搬到Winstart.bat中，再将自动批处理删除，这样可以避免某些安装程序或其他人对你的批处理随意更改，你只需在Winstart.bat中加上以下这么一句：
If exist c:\autoexec.bat del c:\autoexec.bat
或者(在Winstart.bat中)将自动批处理用事先的备份进行更替，这样下次启动时一切又可恢复修改前的原样了(此处备份名称设为C:\win\auto.bak）：
Copy c:\win\auto.bak c:\autoexec.bat /y
三、Dosstart.bat文件
Windows目录下有一个dosstart.bat文件，它会在退出Windows图形界面进入DOS7.0时被自动执行，用户可将光驱、声卡、鼠标、磁盘高速缓冲等驱动程序的命令行从autoexec.bat文件中移到文件dosstart.bat中，这样自然可以减少这些程序一开始启动所占的内存，提高Windows的性能。
四、三个文件的异同
Autoexec.bat：开机后自动运行的批处理文件
Winstart.bat：选择进入Windows时会运行的批处理文件
Dosstart.bat：在Windows中选择关机重新启动计算机到MS-DOS方式后运行的批处理文件
以上3个文件的共同点是：都叫自动批处理文件；
不同点是：执行的时间段不同。